Andreas Pflüger hat mehr als 12 Tatort-Drehbücher geschrieben. Er ist ebenso Verfasser von Hörspielen, Theaterstücken und Romanen. Er hat an den Kinofilmen „Der neunte Tag" und „Strajk – Die Heldin von Danzig" mitgeschrieben. Beide Filme sind von Volker Schlöndorff erfolgreich verfilmt worden. Pflüger schrieb den Roman Operation Rubikon (2004). Auch die Drehbücher zu dem gleichnamigen zweiteiligen Fernsehfilm (Pro 7), der im Milieu von BKA und Geheimdiensten spielt, stammen von ihm.